Marit Paulsen är EU-parlamentariker för Folkpartiet. Hon gjorde comeback i EU-politiken inför senaste EU-valet, 2009. Förmodligen bidrog hon då till Folkpartiets framgångar i valet som ledde till att de fick tre EU-parlamentariker. I valet fick hon flest personröster av alla kandidater. Av alla som röstade på Folkpartiet kryssade 51,5 procent henne. 

De frågor som Paulsen främst engagerat sig i är mat, djur, jord, skog och folkhälsa. Inför valet stormade det kring Paulsen när hon gjorde ett uttalande om att ekologisk mat inte är lösningen på jordbrukets problem.

Marit Paulsen har länge varit en EU-förespråkare och röstades fram till Årets europé i Sverige av den svenska Europarörelsen 1995. Paulsen har deltagit i kampanjerna för att Sverige ska gå med i EU och i euroomröstningen. Tidigare satt hon i parlamentet 1999–2004 och var då känd för sin frispråkighet. 

Marit Paulsen har även gett ut flera böcker som knyter an till hennes politiska intresseområden. Den senaste boken heter ”Lurad av laxen” och hon har även gett ut ”En liten bok om euron” och ”Europa och djuren”.

I maj 2010 antog EU-parlamentet hennes betänkande om utvärdering och bedömning av handlingsplanen för djurskydd och djurs välbefinnande 2006–2010.